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Von 1982 bis 1985 war er Professor im Department of Physics and Astronomy an der
Michigan State University, East Lansing, USA.
Seine didaktisch neu konzipierten Einführungsvorlesungen der Physik für Nebenfächler
(Ingenieure, Naturwissenschaftler und Mediziner)
schlugen sich in zahlreichen Lehrbüchern und Nachschlagewerken nieder.
Seit 1985 ist er Professor für Theoretische Physik an der Johann Wolfgang Goethe-Universität.
Dort entwickelte er Vorlesungszyklen über "Physik mit Computern" und "Mathematische
Methoden der Physik".
Schwerpunkte seiner Forschung sind die Schwerionenphysik, die Physik der Kernmaterie und
Elementarteilchen sowie die Vielteilchentheorie.
Prof. Stöcker hatte verschiedene Gastprofessuren in den USA und Frankreich inne.
Neben der Tätigkeit in Forschung und Lehre zeichnet er als Autor und (Mit-)Herausgeber einer
Reihe von
Büchern und Zeitschriften.
Außer beim Verlag Harri Deutsch veröffentlichte Prof. Stöcker beim Institute of Physics,
London, bei World Scientific Publishing und beim Springer Verlag, New York.
Einige seiner Vorlesungen sind auch
online abgelegt.